Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IRX6P78412 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IRX6P78412 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IRX6P78412 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IRX6P78412 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IRX6P78412 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IRX6P78412 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRX6P78412 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRX6P78412 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRX6P78412 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRX6P78412 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRX6P78412 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRX6P78412 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRX6P78412 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRX6P78412 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRX6P78412 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRX6P78412 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRX6P78412 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRX6P78412 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRX6P78412 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRX6P78412 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRX6P78412 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRX6P78412 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRX6P78412 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRX6P78412 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IRX6P78412 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IRX6P78412 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IRX6P78412 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IRX6P78412 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IRX6P78412 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IRX6P78412 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IRX6P78412 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IRX6P78412 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IRX6P78412 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IRX6P78412 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IRX6P78412 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
IRX6P78412 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
IRX6P78412 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IRX6P78412 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IRX6P78412 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IRX6P78412 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IRX6P78412 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IRX6P78412 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IRX6P78412 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IRX6P78412 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IRX6P78412 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IRX6P78412 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IRX6P78412 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IRX6P78412 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IRX6P78412 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IRX6P78412 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
IRX6P78412 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IRX6P78412 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IRX6P78412 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IRX6P78412 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IRX6P78412 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IRX6P78412 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IRX6P78412 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IRX6P78412 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IRX6P78412 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IRX6P78412 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IRX6P78412 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IRX6P78412 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IRX6P78412 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IRX6P78412 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IRX6P78412 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IRX6P78412 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IRX6P78412 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IRX6P78412 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IRX6P78412 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IRX6P78412 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IRX6P78412 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IRX6P78412 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IRX6P78412 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IRX6P78412 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IRX6P78412 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IRX6P78412 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IRX6P78412 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IRX6P78412 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IRX6P78412 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IRX6P78412 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IRX6P78412 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
IRX6P78412 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
IRX6P78412 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
IRX6P78412 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
IRX6P78412 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
IRX6P78412 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IRX6P78412 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IRX6P78412 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
IRX6P78412 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IRX6P78412 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IRX6P78412 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IRX6P78412 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IRX6P78412 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IRX6P78412 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IRX6P78412 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IRX6P78412 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IRX6P78412 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IRX6P78412 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IRX6P78412 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms