Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TUBB4BP68371 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TUBB4BP68371 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms