Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP1S1P61966 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AP1S1P61966 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AP1S1P61966 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AP1S1P61966 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
AP1S1P61966 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP1S1P61966 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP1S1P61966 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP1S1P61966 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP1S1P61966 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AP1S1P61966 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP1S1P61966 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP1S1P61966 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP1S1P61966 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP1S1P61966 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP1S1P61966 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP1S1P61966 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
AP1S1P61966 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AP1S1P61966 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP1S1P61966 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AP1S1P61966 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
AP1S1P61966 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP1S1P61966 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP1S1P61966 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP1S1P61966 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP1S1P61966 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
AP1S1P61966 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AP1S1P61966 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AP1S1P61966 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
AP1S1P61966 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP1S1P61966 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP1S1P61966 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AP1S1P61966 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
AP1S1P61966 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP1S1P61966 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP1S1P61966 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
AP1S1P61966 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AP1S1P61966 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP1S1P61966 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
AP1S1P61966 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
AP1S1P61966 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP1S1P61966 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AP1S1P61966 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP1S1P61966 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
AP1S1P61966 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AP1S1P61966 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
AP1S1P61966 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
AP1S1P61966 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.3■■□□□ 1
AP1S1P61966 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP1S1P61966 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP1S1P61966 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AP1S1P61966 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AP1S1P61966 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
AP1S1P61966 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AP1S1P61966 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AP1S1P61966 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AP1S1P61966 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.3■■□□□ 1
AP1S1P61966 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.3■■□□□ 1
AP1S1P61966 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP1S1P61966 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.3■■□□□ 1
AP1S1P61966 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.3■■□□□ 1
AP1S1P61966 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
AP1S1P61966 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AP1S1P61966 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AP1S1P61966 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
AP1S1P61966 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
AP1S1P61966 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AP1S1P61966 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP1S1P61966 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP1S1P61966 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AP1S1P61966 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP1S1P61966 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP1S1P61966 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP1S1P61966 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AP1S1P61966 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AP1S1P61966 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP1S1P61966 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP1S1P61966 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP1S1P61966 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP1S1P61966 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP1S1P61966 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AP1S1P61966 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AP1S1P61966 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AP1S1P61966 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP1S1P61966 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP1S1P61966 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AP1S1P61966 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP1S1P61966 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AP1S1P61966 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP1S1P61966 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AP1S1P61966 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AP1S1P61966 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms