Protein–RNA interactions for Protein: P61586

RHOA, Transforming protein RhoA, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOAP61586 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOAP61586 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHOAP61586 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOAP61586 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOAP61586 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOAP61586 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOAP61586 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOAP61586 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOAP61586 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOAP61586 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOAP61586 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOAP61586 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHOAP61586 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOAP61586 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOAP61586 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOAP61586 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOAP61586 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOAP61586 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOAP61586 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOAP61586 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOAP61586 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOAP61586 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOAP61586 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOAP61586 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOAP61586 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RHOAP61586 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOAP61586 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOAP61586 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOAP61586 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOAP61586 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOAP61586 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOAP61586 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOAP61586 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOAP61586 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOAP61586 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOAP61586 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOAP61586 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOAP61586 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOAP61586 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RHOAP61586 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOAP61586 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOAP61586 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOAP61586 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOAP61586 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOAP61586 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOAP61586 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOAP61586 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOAP61586 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOAP61586 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOAP61586 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOAP61586 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOAP61586 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOAP61586 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOAP61586 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOAP61586 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOAP61586 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RHOAP61586 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOAP61586 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOAP61586 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOAP61586 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOAP61586 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOAP61586 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOAP61586 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOAP61586 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOAP61586 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOAP61586 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOAP61586 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOAP61586 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOAP61586 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOAP61586 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOAP61586 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RHOAP61586 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOAP61586 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOAP61586 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOAP61586 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOAP61586 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOAP61586 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOAP61586 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOAP61586 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOAP61586 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOAP61586 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOAP61586 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOAP61586 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOAP61586 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOAP61586 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOAP61586 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOAP61586 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOAP61586 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOAP61586 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RHOAP61586 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOAP61586 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOAP61586 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOAP61586 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOAP61586 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOAP61586 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOAP61586 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOAP61586 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOAP61586 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOAP61586 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RHOAP61586 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms