Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTP1P59025 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTP1P59025 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTP1P59025 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTP1P59025 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTP1P59025 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTP1P59025 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTP1P59025 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RTP1P59025 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTP1P59025 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTP1P59025 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTP1P59025 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTP1P59025 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTP1P59025 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTP1P59025 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTP1P59025 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTP1P59025 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTP1P59025 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTP1P59025 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTP1P59025 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTP1P59025 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RTP1P59025 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTP1P59025 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTP1P59025 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTP1P59025 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTP1P59025 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTP1P59025 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RTP1P59025 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RTP1P59025 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTP1P59025 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTP1P59025 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RTP1P59025 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RTP1P59025 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTP1P59025 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTP1P59025 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTP1P59025 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTP1P59025 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RTP1P59025 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTP1P59025 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTP1P59025 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTP1P59025 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTP1P59025 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTP1P59025 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTP1P59025 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTP1P59025 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTP1P59025 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTP1P59025 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTP1P59025 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTP1P59025 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RTP1P59025 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTP1P59025 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTP1P59025 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTP1P59025 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTP1P59025 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTP1P59025 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTP1P59025 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTP1P59025 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTP1P59025 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTP1P59025 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTP1P59025 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTP1P59025 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RTP1P59025 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTP1P59025 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTP1P59025 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTP1P59025 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RTP1P59025 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTP1P59025 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTP1P59025 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTP1P59025 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTP1P59025 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RTP1P59025 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTP1P59025 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTP1P59025 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RTP1P59025 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RTP1P59025 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTP1P59025 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RTP1P59025 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTP1P59025 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTP1P59025 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTP1P59025 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTP1P59025 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTP1P59025 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTP1P59025 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RTP1P59025 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RTP1P59025 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RTP1P59025 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTP1P59025 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTP1P59025 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTP1P59025 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTP1P59025 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTP1P59025 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTP1P59025 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RTP1P59025 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTP1P59025 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RTP1P59025 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTP1P59025 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTP1P59025 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTP1P59025 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RTP1P59025 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RTP1P59025 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms