Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2BFSP57053 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2BFSP57053 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms