Protein–RNA interactions for Protein: P56559

ARL4C, ADP-ribosylation factor-like protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4CP56559 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ARL4CP56559 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ARL4CP56559 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms