Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCL23P55773 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCL23P55773 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCL23P55773 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCL23P55773 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCL23P55773 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCL23P55773 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCL23P55773 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCL23P55773 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCL23P55773 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCL23P55773 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCL23P55773 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCL23P55773 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCL23P55773 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCL23P55773 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCL23P55773 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCL23P55773 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCL23P55773 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCL23P55773 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCL23P55773 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCL23P55773 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCL23P55773 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCL23P55773 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCL23P55773 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCL23P55773 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCL23P55773 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCL23P55773 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCL23P55773 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCL23P55773 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCL23P55773 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCL23P55773 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCL23P55773 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCL23P55773 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCL23P55773 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCL23P55773 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCL23P55773 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCL23P55773 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCL23P55773 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCL23P55773 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCL23P55773 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCL23P55773 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCL23P55773 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCL23P55773 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCL23P55773 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCL23P55773 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCL23P55773 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCL23P55773 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCL23P55773 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCL23P55773 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCL23P55773 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCL23P55773 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCL23P55773 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCL23P55773 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCL23P55773 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL23P55773 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL23P55773 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL23P55773 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL23P55773 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL23P55773 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL23P55773 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL23P55773 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL23P55773 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL23P55773 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL23P55773 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL23P55773 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL23P55773 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL23P55773 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL23P55773 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL23P55773 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL23P55773 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCL23P55773 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCL23P55773 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCL23P55773 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCL23P55773 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCL23P55773 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCL23P55773 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCL23P55773 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCL23P55773 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCL23P55773 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCL23P55773 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCL23P55773 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCL23P55773 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCL23P55773 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCL23P55773 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCL23P55773 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCL23P55773 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCL23P55773 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCL23P55773 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCL23P55773 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCL23P55773 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCL23P55773 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCL23P55773 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCL23P55773 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL23P55773 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL23P55773 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL23P55773 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL23P55773 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL23P55773 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL23P55773 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCL23P55773 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms