Protein–RNA interactions for Protein: P55286

CDH8, Cadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH8P55286 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH8P55286 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH8P55286 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH8P55286 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH8P55286 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH8P55286 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH8P55286 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH8P55286 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH8P55286 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDH8P55286 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH8P55286 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH8P55286 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH8P55286 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH8P55286 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH8P55286 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH8P55286 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH8P55286 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH8P55286 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH8P55286 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH8P55286 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH8P55286 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDH8P55286 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH8P55286 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH8P55286 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH8P55286 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH8P55286 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH8P55286 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH8P55286 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH8P55286 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH8P55286 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH8P55286 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH8P55286 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH8P55286 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH8P55286 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH8P55286 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH8P55286 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH8P55286 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH8P55286 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDH8P55286 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH8P55286 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH8P55286 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH8P55286 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH8P55286 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH8P55286 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH8P55286 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH8P55286 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH8P55286 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH8P55286 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH8P55286 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH8P55286 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH8P55286 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH8P55286 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH8P55286 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH8P55286 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH8P55286 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH8P55286 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH8P55286 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH8P55286 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDH8P55286 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH8P55286 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH8P55286 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH8P55286 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH8P55286 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH8P55286 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH8P55286 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH8P55286 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH8P55286 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH8P55286 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH8P55286 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH8P55286 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH8P55286 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH8P55286 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH8P55286 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH8P55286 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH8P55286 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDH8P55286 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH8P55286 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH8P55286 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH8P55286 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH8P55286 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH8P55286 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH8P55286 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH8P55286 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH8P55286 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH8P55286 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH8P55286 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDH8P55286 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH8P55286 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH8P55286 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH8P55286 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH8P55286 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH8P55286 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH8P55286 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH8P55286 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDH8P55286 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDH8P55286 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDH8P55286 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDH8P55286 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDH8P55286 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDH8P55286 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms