Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP9P55211 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP9P55211 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP9P55211 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP9P55211 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP9P55211 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP9P55211 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP9P55211 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP9P55211 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP9P55211 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP9P55211 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP9P55211 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP9P55211 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP9P55211 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP9P55211 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP9P55211 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP9P55211 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP9P55211 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASP9P55211 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP9P55211 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP9P55211 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP9P55211 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP9P55211 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP9P55211 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP9P55211 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP9P55211 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP9P55211 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP9P55211 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP9P55211 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP9P55211 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP9P55211 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASP9P55211 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP9P55211 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP9P55211 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP9P55211 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP9P55211 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP9P55211 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP9P55211 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP9P55211 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP9P55211 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP9P55211 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP9P55211 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP9P55211 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP9P55211 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP9P55211 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP9P55211 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP9P55211 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP9P55211 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP9P55211 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP9P55211 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP9P55211 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP9P55211 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CASP9P55211 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP9P55211 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP9P55211 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP9P55211 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP9P55211 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP9P55211 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP9P55211 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP9P55211 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP9P55211 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP9P55211 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP9P55211 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP9P55211 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP9P55211 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP9P55211 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP9P55211 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP9P55211 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP9P55211 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP9P55211 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP9P55211 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CASP9P55211 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASP9P55211 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASP9P55211 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASP9P55211 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASP9P55211 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASP9P55211 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASP9P55211 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CASP9P55211 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASP9P55211 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CASP9P55211 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CASP9P55211 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASP9P55211 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASP9P55211 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASP9P55211 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASP9P55211 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASP9P55211 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASP9P55211 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASP9P55211 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP9P55211 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP9P55211 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP9P55211 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP9P55211 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP9P55211 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP9P55211 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP9P55211 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP9P55211 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP9P55211 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP9P55211 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CASP9P55211 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms