Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BRPF1P55201 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
BRPF1P55201 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms