Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ITGA8P53708 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ITGA8P53708 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms