Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF143P52747 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF143P52747 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF143P52747 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF143P52747 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF143P52747 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF143P52747 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF143P52747 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF143P52747 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF143P52747 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF143P52747 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF143P52747 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF143P52747 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF143P52747 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ZNF143P52747 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF143P52747 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF143P52747 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF143P52747 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF143P52747 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF143P52747 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF143P52747 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF143P52747 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF143P52747 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF143P52747 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZNF143P52747 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZNF143P52747 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms