Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC38.1■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC38.09■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC38.08■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.07■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC38.07■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC38.07■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
SMARCA2P51531 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
SMARCA2P51531 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
SMARCA2P51531 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
SMARCA2P51531 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
SMARCA2P51531 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
SMARCA2P51531 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
SMARCA2P51531 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
SMARCA2P51531 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
SMARCA2P51531 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
SMARCA2P51531 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
SMARCA2P51531 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
SMARCA2P51531 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
SMARCA2P51531 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC38.06■■■■□ 3.68
SMARCA2P51531 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
SMARCA2P51531 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
SMARCA2P51531 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
SMARCA2P51531 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
SMARCA2P51531 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
SMARCA2P51531 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
SMARCA2P51531 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
SMARCA2P51531 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
SMARCA2P51531 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
SMARCA2P51531 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
SMARCA2P51531 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
SMARCA2P51531 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
SMARCA2P51531 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
SMARCA2P51531 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
SMARCA2P51531 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
SMARCA2P51531 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
SMARCA2P51531 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
SMARCA2P51531 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
SMARCA2P51531 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
SMARCA2P51531 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
SMARCA2P51531 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
SMARCA2P51531 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
SMARCA2P51531 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
SMARCA2P51531 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
SMARCA2P51531 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC38.02■■■■□ 3.68
SMARCA2P51531 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
SMARCA2P51531 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
SMARCA2P51531 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
SMARCA2P51531 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
SMARCA2P51531 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
SMARCA2P51531 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
SMARCA2P51531 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
SMARCA2P51531 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
SMARCA2P51531 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms