Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX5P50542 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX5P50542 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX5P50542 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX5P50542 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX5P50542 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX5P50542 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX5P50542 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX5P50542 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX5P50542 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX5P50542 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX5P50542 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX5P50542 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX5P50542 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX5P50542 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX5P50542 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX5P50542 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX5P50542 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX5P50542 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX5P50542 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX5P50542 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX5P50542 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX5P50542 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX5P50542 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX5P50542 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX5P50542 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX5P50542 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX5P50542 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX5P50542 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX5P50542 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX5P50542 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX5P50542 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX5P50542 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX5P50542 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX5P50542 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX5P50542 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX5P50542 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX5P50542 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX5P50542 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX5P50542 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX5P50542 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX5P50542 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX5P50542 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX5P50542 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX5P50542 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX5P50542 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX5P50542 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX5P50542 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX5P50542 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX5P50542 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX5P50542 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX5P50542 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX5P50542 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX5P50542 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX5P50542 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX5P50542 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX5P50542 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX5P50542 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX5P50542 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX5P50542 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX5P50542 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX5P50542 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX5P50542 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX5P50542 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX5P50542 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX5P50542 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX5P50542 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX5P50542 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX5P50542 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX5P50542 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX5P50542 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX5P50542 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX5P50542 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX5P50542 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX5P50542 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX5P50542 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX5P50542 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX5P50542 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX5P50542 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PEX5P50542 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PEX5P50542 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX5P50542 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX5P50542 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX5P50542 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX5P50542 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX5P50542 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX5P50542 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX5P50542 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX5P50542 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX5P50542 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX5P50542 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX5P50542 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX5P50542 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX5P50542 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX5P50542 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX5P50542 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX5P50542 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX5P50542 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX5P50542 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX5P50542 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms