Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRE11P49959 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRE11P49959 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRE11P49959 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRE11P49959 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRE11P49959 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRE11P49959 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRE11P49959 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRE11P49959 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRE11P49959 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRE11P49959 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRE11P49959 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRE11P49959 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRE11P49959 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRE11P49959 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRE11P49959 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRE11P49959 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRE11P49959 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRE11P49959 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRE11P49959 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRE11P49959 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRE11P49959 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRE11P49959 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRE11P49959 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRE11P49959 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRE11P49959 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRE11P49959 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRE11P49959 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRE11P49959 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRE11P49959 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRE11P49959 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRE11P49959 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRE11P49959 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRE11P49959 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRE11P49959 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRE11P49959 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRE11P49959 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRE11P49959 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRE11P49959 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRE11P49959 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRE11P49959 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRE11P49959 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MRE11P49959 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MRE11P49959 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRE11P49959 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRE11P49959 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRE11P49959 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRE11P49959 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRE11P49959 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRE11P49959 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRE11P49959 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRE11P49959 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MRE11P49959 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRE11P49959 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRE11P49959 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRE11P49959 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRE11P49959 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRE11P49959 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRE11P49959 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRE11P49959 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRE11P49959 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MRE11P49959 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRE11P49959 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRE11P49959 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRE11P49959 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRE11P49959 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRE11P49959 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRE11P49959 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRE11P49959 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRE11P49959 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRE11P49959 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRE11P49959 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRE11P49959 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRE11P49959 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MRE11P49959 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRE11P49959 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRE11P49959 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MRE11P49959 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRE11P49959 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MRE11P49959 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MRE11P49959 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MRE11P49959 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRE11P49959 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRE11P49959 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MRE11P49959 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRE11P49959 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRE11P49959 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRE11P49959 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRE11P49959 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRE11P49959 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRE11P49959 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRE11P49959 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRE11P49959 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRE11P49959 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRE11P49959 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRE11P49959 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRE11P49959 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRE11P49959 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRE11P49959 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRE11P49959 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms