Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSEN2P49810 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSEN2P49810 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms