Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NUP153P49790 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NUP153P49790 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NUP153P49790 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NUP153P49790 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NUP153P49790 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NUP153P49790 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NUP153P49790 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NUP153P49790 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NUP153P49790 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
NUP153P49790 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NUP153P49790 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NUP153P49790 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NUP153P49790 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NUP153P49790 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
NUP153P49790 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NUP153P49790 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NUP153P49790 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NUP153P49790 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NUP153P49790 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NUP153P49790 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NUP153P49790 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NUP153P49790 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
NUP153P49790 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NUP153P49790 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NUP153P49790 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NUP153P49790 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
NUP153P49790 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NUP153P49790 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
NUP153P49790 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NUP153P49790 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NUP153P49790 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NUP153P49790 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NUP153P49790 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NUP153P49790 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NUP153P49790 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NUP153P49790 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NUP153P49790 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NUP153P49790 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NUP153P49790 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NUP153P49790 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NUP153P49790 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NUP153P49790 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NUP153P49790 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NUP153P49790 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NUP153P49790 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NUP153P49790 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NUP153P49790 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NUP153P49790 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NUP153P49790 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NUP153P49790 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NUP153P49790 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NUP153P49790 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NUP153P49790 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NUP153P49790 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NUP153P49790 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
NUP153P49790 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NUP153P49790 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NUP153P49790 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NUP153P49790 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NUP153P49790 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NUP153P49790 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NUP153P49790 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NUP153P49790 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NUP153P49790 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
NUP153P49790 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
NUP153P49790 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NUP153P49790 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NUP153P49790 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NUP153P49790 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NUP153P49790 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NUP153P49790 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NUP153P49790 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NUP153P49790 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NUP153P49790 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NUP153P49790 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NUP153P49790 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NUP153P49790 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NUP153P49790 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NUP153P49790 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NUP153P49790 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NUP153P49790 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NUP153P49790 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NUP153P49790 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NUP153P49790 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
NUP153P49790 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NUP153P49790 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
NUP153P49790 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NUP153P49790 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NUP153P49790 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NUP153P49790 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NUP153P49790 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NUP153P49790 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NUP153P49790 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NUP153P49790 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NUP153P49790 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NUP153P49790 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NUP153P49790 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NUP153P49790 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NUP153P49790 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms