Protein–RNA interactions for Protein: P49590

HARS2, Probable histidine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARS2P49590 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HARS2P49590 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HARS2P49590 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HARS2P49590 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HARS2P49590 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HARS2P49590 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HARS2P49590 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HARS2P49590 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HARS2P49590 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HARS2P49590 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HARS2P49590 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HARS2P49590 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HARS2P49590 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HARS2P49590 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HARS2P49590 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HARS2P49590 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HARS2P49590 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HARS2P49590 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HARS2P49590 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HARS2P49590 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HARS2P49590 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HARS2P49590 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HARS2P49590 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HARS2P49590 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HARS2P49590 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HARS2P49590 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HARS2P49590 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HARS2P49590 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HARS2P49590 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HARS2P49590 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HARS2P49590 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HARS2P49590 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HARS2P49590 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HARS2P49590 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HARS2P49590 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HARS2P49590 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HARS2P49590 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HARS2P49590 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HARS2P49590 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HARS2P49590 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HARS2P49590 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HARS2P49590 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HARS2P49590 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HARS2P49590 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HARS2P49590 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HARS2P49590 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HARS2P49590 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HARS2P49590 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HARS2P49590 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HARS2P49590 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HARS2P49590 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HARS2P49590 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HARS2P49590 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HARS2P49590 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HARS2P49590 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HARS2P49590 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HARS2P49590 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HARS2P49590 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HARS2P49590 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HARS2P49590 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HARS2P49590 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HARS2P49590 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HARS2P49590 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HARS2P49590 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HARS2P49590 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HARS2P49590 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HARS2P49590 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HARS2P49590 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HARS2P49590 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HARS2P49590 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HARS2P49590 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HARS2P49590 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HARS2P49590 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HARS2P49590 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HARS2P49590 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HARS2P49590 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HARS2P49590 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HARS2P49590 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HARS2P49590 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HARS2P49590 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HARS2P49590 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HARS2P49590 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HARS2P49590 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HARS2P49590 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HARS2P49590 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HARS2P49590 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
HARS2P49590 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HARS2P49590 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HARS2P49590 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HARS2P49590 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HARS2P49590 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HARS2P49590 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HARS2P49590 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HARS2P49590 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HARS2P49590 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HARS2P49590 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HARS2P49590 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HARS2P49590 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HARS2P49590 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HARS2P49590 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms