Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMUP48645 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMUP48645 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NMUP48645 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NMUP48645 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NMUP48645 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NMUP48645 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NMUP48645 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NMUP48645 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NMUP48645 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NMUP48645 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NMUP48645 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NMUP48645 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NMUP48645 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NMUP48645 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NMUP48645 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NMUP48645 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NMUP48645 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NMUP48645 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NMUP48645 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NMUP48645 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NMUP48645 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NMUP48645 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NMUP48645 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NMUP48645 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMUP48645 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMUP48645 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMUP48645 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NMUP48645 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NMUP48645 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMUP48645 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NMUP48645 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NMUP48645 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMUP48645 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NMUP48645 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMUP48645 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMUP48645 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NMUP48645 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMUP48645 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMUP48645 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NMUP48645 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NMUP48645 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NMUP48645 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NMUP48645 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMUP48645 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NMUP48645 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NMUP48645 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NMUP48645 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NMUP48645 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMUP48645 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMUP48645 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NMUP48645 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMUP48645 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMUP48645 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NMUP48645 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMUP48645 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NMUP48645 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMUP48645 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NMUP48645 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMUP48645 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NMUP48645 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NMUP48645 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMUP48645 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMUP48645 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMUP48645 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
NMUP48645 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMUP48645 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMUP48645 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NMUP48645 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMUP48645 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NMUP48645 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMUP48645 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMUP48645 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
NMUP48645 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMUP48645 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMUP48645 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMUP48645 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NMUP48645 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMUP48645 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMUP48645 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMUP48645 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMUP48645 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NMUP48645 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NMUP48645 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NMUP48645 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NMUP48645 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NMUP48645 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NMUP48645 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NMUP48645 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NMUP48645 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NMUP48645 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NMUP48645 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NMUP48645 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NMUP48645 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.05■□□□□ 0
NMUP48645 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NMUP48645 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NMUP48645 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
NMUP48645 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NMUP48645 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NMUP48645 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms