Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CSN1S1P47710 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSN1S1P47710 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSN1S1P47710 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CSN1S1P47710 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSN1S1P47710 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSN1S1P47710 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSN1S1P47710 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSN1S1P47710 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CSN1S1P47710 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSN1S1P47710 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSN1S1P47710 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSN1S1P47710 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSN1S1P47710 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSN1S1P47710 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSN1S1P47710 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CSN1S1P47710 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CSN1S1P47710 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CSN1S1P47710 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CSN1S1P47710 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSN1S1P47710 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSN1S1P47710 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSN1S1P47710 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSN1S1P47710 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CSN1S1P47710 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSN1S1P47710 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CSN1S1P47710 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSN1S1P47710 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSN1S1P47710 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CSN1S1P47710 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms