Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTHFRP42898 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms