Protein–RNA interactions for Protein: P40356

PGD1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 3, yeastyeast

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PGD1P40356 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt2.33□□□□□ -2.04
PGD1P40356 MRPL27YBR282W 441 nt2.33□□□□□ -2.04
PGD1P40356 NUF2YOL069W 1356 nt2.33□□□□□ -2.04
PGD1P40356 AKR1YDR264C 2295 nt2.33□□□□□ -2.04
PGD1P40356 MLH1YMR167W 2310 nt2.33□□□□□ -2.04
PGD1P40356 HFD1YMR110C 1599 nt2.32□□□□□ -2.04
PGD1P40356 PEX6YNL329C 3093 nt2.32□□□□□ -2.04
PGD1P40356 THO1YER063W 657 nt2.32□□□□□ -2.04
PGD1P40356 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.32□□□□□ -2.04
PGD1P40356 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.32□□□□□ -2.04
PGD1P40356 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.32□□□□□ -2.04
PGD1P40356 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.32□□□□□ -2.04
PGD1P40356 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.32□□□□□ -2.04
PGD1P40356 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.32□□□□□ -2.04
PGD1P40356 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.32□□□□□ -2.04
PGD1P40356 EPT1YHR123W 1176 nt2.32□□□□□ -2.04
PGD1P40356 SNX4YJL036W 1272 nt2.32□□□□□ -2.04
PGD1P40356 YLR311CYLR311C 348 nt2.32□□□□□ -2.04
PGD1P40356 RPL23AYBL087C 414 nt2.32□□□□□ -2.04
PGD1P40356 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt2.32□□□□□ -2.04
PGD1P40356 RPA43YOR340C 981 nt2.32□□□□□ -2.04
PGD1P40356 RDS2YPL133C 1341 nt2.32□□□□□ -2.04
PGD1P40356 PIN4YBL051C 2007 nt2.32□□□□□ -2.04
PGD1P40356 ILS1YBL076C 3219 nt2.32□□□□□ -2.04
PGD1P40356 SMY2YBR172C 2223 nt2.32□□□□□ -2.04
PGD1P40356 TAF2YCR042C 4224 nt2.31□□□□□ -2.04
PGD1P40356 CLN2YPL256C 1638 nt2.31□□□□□ -2.04
PGD1P40356 BCK1YJL095W 4437 nt2.31□□□□□ -2.04
PGD1P40356 YKU80YMR106C 1890 nt2.31□□□□□ -2.04
PGD1P40356 OPI6YDL096C 327 nt2.31□□□□□ -2.04
PGD1P40356 RRP42YDL111C 798 nt2.31□□□□□ -2.04
PGD1P40356 YDR222WYDR222W 1248 nt2.31□□□□□ -2.04
PGD1P40356 ISC10YER180C 804 nt2.31□□□□□ -2.04
PGD1P40356 CDC26YFR036W 375 nt2.31□□□□□ -2.04
PGD1P40356 YGR293CYGR293C 462 nt2.31□□□□□ -2.04
PGD1P40356 DOG1YHR044C 741 nt2.31□□□□□ -2.04
PGD1P40356 MRPL6YHR147C 645 nt2.31□□□□□ -2.04
PGD1P40356 TFA2YKR062W 987 nt2.31□□□□□ -2.04
PGD1P40356 USB1YLR132C 873 nt2.31□□□□□ -2.04
PGD1P40356 YML047W-AYML047W-A 366 nt2.31□□□□□ -2.04
PGD1P40356 SPO20YMR017W 1194 nt2.31□□□□□ -2.04
PGD1P40356 YNL109WYNL109W 546 nt2.31□□□□□ -2.04
PGD1P40356 AAH1YNL141W 1044 nt2.31□□□□□ -2.04
PGD1P40356 TRM112YNR046W 408 nt2.31□□□□□ -2.04
PGD1P40356 RPS10AYOR293W 318 nt2.31□□□□□ -2.04
PGD1P40356 MRP2YPR166C 348 nt2.31□□□□□ -2.04
PGD1P40356 GRX1YCL035C 333 nt2.31□□□□□ -2.04
PGD1P40356 RIM13YMR154C 2184 nt2.31□□□□□ -2.04
PGD1P40356 KIN3YAR018C 1308 nt2.31□□□□□ -2.04
PGD1P40356 ISW1YBR245C 3390 nt2.3□□□□□ -2.04
PGD1P40356 NHP10YDL002C 612 nt2.3□□□□□ -2.04
PGD1P40356 PTI1YGR156W 1278 nt2.3□□□□□ -2.04
PGD1P40356 INP1YMR204C 1263 nt2.3□□□□□ -2.04
PGD1P40356 TEX1YNL253W 1269 nt2.3□□□□□ -2.04
PGD1P40356 JID1YPR061C 906 nt2.3□□□□□ -2.04
PGD1P40356 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt2.3□□□□□ -2.04
PGD1P40356 YPR142CYPR142C 564 nt2.3□□□□□ -2.04
PGD1P40356 UTP15YMR093W 1542 nt2.3□□□□□ -2.04
PGD1P40356 RPA190YOR341W 4995 nt2.29□□□□□ -2.04
PGD1P40356 TOP2YNL088W 4287 nt2.29□□□□□ -2.04
PGD1P40356 YDL026WYDL026W 312 nt2.29□□□□□ -2.04
PGD1P40356 YGL118CYGL118C 438 nt2.29□□□□□ -2.04
PGD1P40356 EBP2YKL172W 1284 nt2.29□□□□□ -2.04
PGD1P40356 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt2.29□□□□□ -2.04
PGD1P40356 RGR1YLR071C 3249 nt2.29□□□□□ -2.04
PGD1P40356 TRA1YHR099W 11235 nt2.29□□□□□ -2.04
PGD1P40356 MED1YPR070W 1701 nt2.28□□□□□ -2.04
PGD1P40356 STE6YKL209C 3873 nt2.28□□□□□ -2.04
PGD1P40356 ITT1YML068W 1395 nt2.28□□□□□ -2.04
PGD1P40356 TSC13YDL015C 933 nt2.28□□□□□ -2.04
PGD1P40356 PEF1YGR058W 1008 nt2.28□□□□□ -2.04
PGD1P40356 YGR190CYGR190C 366 nt2.28□□□□□ -2.04
PGD1P40356 EFG1YGR271C-A 702 nt2.28□□□□□ -2.04
PGD1P40356 YHR097CYHR097C 1101 nt2.28□□□□□ -2.04
PGD1P40356 PCL7YIL050W 858 nt2.28□□□□□ -2.04
PGD1P40356 YJR128WYJR128W 360 nt2.28□□□□□ -2.04
PGD1P40356 MIC27YNL100W 705 nt2.28□□□□□ -2.04
PGD1P40356 ATP3YBR039W 936 nt2.28□□□□□ -2.04
PGD1P40356 YPR050CYPR050C 414 nt2.28□□□□□ -2.04
PGD1P40356 PIS1YPR113W 663 nt2.28□□□□□ -2.04
PGD1P40356 SIR3YLR442C 2937 nt2.28□□□□□ -2.05
PGD1P40356 RPN4YDL020C 1596 nt2.27□□□□□ -2.05
PGD1P40356 YML096WYML096W 1578 nt2.27□□□□□ -2.05
PGD1P40356 RPS14AYCR031C 414 nt2.27□□□□□ -2.05
PGD1P40356 RDI1YDL135C 609 nt2.27□□□□□ -2.05
PGD1P40356 RPL35BYDL136W 363 nt2.27□□□□□ -2.05
PGD1P40356 YDL186WYDL186W 834 nt2.27□□□□□ -2.05
PGD1P40356 DTD1YDL219W 453 nt2.27□□□□□ -2.05
PGD1P40356 LRS4YDR439W 1044 nt2.27□□□□□ -2.05
PGD1P40356 FMP32YFL046W 624 nt2.27□□□□□ -2.05
PGD1P40356 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt2.27□□□□□ -2.05
PGD1P40356 YGR064WYGR064W 369 nt2.27□□□□□ -2.05
PGD1P40356 YGR114CYGR114C 390 nt2.27□□□□□ -2.05
PGD1P40356 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt2.27□□□□□ -2.05
PGD1P40356 MTD1YKR080W 963 nt2.27□□□□□ -2.05
PGD1P40356 PSY3YLR376C 729 nt2.27□□□□□ -2.05
PGD1P40356 YBL028CYBL028C 321 nt2.27□□□□□ -2.05
PGD1P40356 YNL035CYNL035C 1170 nt2.27□□□□□ -2.05
PGD1P40356 PFY1YOR122C 381 nt2.27□□□□□ -2.05
PGD1P40356 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt2.27□□□□□ -2.05
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