Protein–RNA interactions for Protein: P40197

GP5, Platelet glycoprotein V, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP5P40197 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GP5P40197 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GP5P40197 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GP5P40197 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GP5P40197 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GP5P40197 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GP5P40197 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GP5P40197 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GP5P40197 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GP5P40197 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GP5P40197 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GP5P40197 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GP5P40197 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GP5P40197 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GP5P40197 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GP5P40197 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GP5P40197 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GP5P40197 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GP5P40197 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GP5P40197 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GP5P40197 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GP5P40197 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GP5P40197 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GP5P40197 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GP5P40197 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GP5P40197 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GP5P40197 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GP5P40197 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GP5P40197 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GP5P40197 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GP5P40197 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GP5P40197 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GP5P40197 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GP5P40197 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GP5P40197 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GP5P40197 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GP5P40197 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GP5P40197 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GP5P40197 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GP5P40197 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GP5P40197 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GP5P40197 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GP5P40197 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GP5P40197 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GP5P40197 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GP5P40197 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GP5P40197 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GP5P40197 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GP5P40197 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GP5P40197 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GP5P40197 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GP5P40197 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GP5P40197 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GP5P40197 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GP5P40197 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GP5P40197 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GP5P40197 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GP5P40197 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GP5P40197 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GP5P40197 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GP5P40197 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GP5P40197 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GP5P40197 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GP5P40197 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GP5P40197 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GP5P40197 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GP5P40197 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GP5P40197 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GP5P40197 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GP5P40197 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GP5P40197 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GP5P40197 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GP5P40197 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GP5P40197 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GP5P40197 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GP5P40197 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GP5P40197 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GP5P40197 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GP5P40197 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GP5P40197 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GP5P40197 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GP5P40197 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GP5P40197 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GP5P40197 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GP5P40197 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GP5P40197 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GP5P40197 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GP5P40197 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GP5P40197 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GP5P40197 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GP5P40197 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GP5P40197 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GP5P40197 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GP5P40197 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GP5P40197 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GP5P40197 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GP5P40197 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GP5P40197 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GP5P40197 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GP5P40197 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms