Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ETFBP38117 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ETFBP38117 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ETFBP38117 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ETFBP38117 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ETFBP38117 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ETFBP38117 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ETFBP38117 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ETFBP38117 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ETFBP38117 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ETFBP38117 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ETFBP38117 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ETFBP38117 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ETFBP38117 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ETFBP38117 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ETFBP38117 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ETFBP38117 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ETFBP38117 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ETFBP38117 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ETFBP38117 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ETFBP38117 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ETFBP38117 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ETFBP38117 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ETFBP38117 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ETFBP38117 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ETFBP38117 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ETFBP38117 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ETFBP38117 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ETFBP38117 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ETFBP38117 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ETFBP38117 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ETFBP38117 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ETFBP38117 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ETFBP38117 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ETFBP38117 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ETFBP38117 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ETFBP38117 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ETFBP38117 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ETFBP38117 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ETFBP38117 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ETFBP38117 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ETFBP38117 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ETFBP38117 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ETFBP38117 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ETFBP38117 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ETFBP38117 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ETFBP38117 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ETFBP38117 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ETFBP38117 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ETFBP38117 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ETFBP38117 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ETFBP38117 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ETFBP38117 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ETFBP38117 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ETFBP38117 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ETFBP38117 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ETFBP38117 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ETFBP38117 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ETFBP38117 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ETFBP38117 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ETFBP38117 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ETFBP38117 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ETFBP38117 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ETFBP38117 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ETFBP38117 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ETFBP38117 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ETFBP38117 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ETFBP38117 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ETFBP38117 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ETFBP38117 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ETFBP38117 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ETFBP38117 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ETFBP38117 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ETFBP38117 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ETFBP38117 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ETFBP38117 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ETFBP38117 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ETFBP38117 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ETFBP38117 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ETFBP38117 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ETFBP38117 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ETFBP38117 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ETFBP38117 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ETFBP38117 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ETFBP38117 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ETFBP38117 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ETFBP38117 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ETFBP38117 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ETFBP38117 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ETFBP38117 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ETFBP38117 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ETFBP38117 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ETFBP38117 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ETFBP38117 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ETFBP38117 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ETFBP38117 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ETFBP38117 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ETFBP38117 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ETFBP38117 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ETFBP38117 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms