Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATP5C1P36542 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP5C1P36542 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms