Protein–RNA interactions for Protein: P34077

NIC96, Nucleoporin NIC96, yeastyeast

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIC96P34077 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt3.84□□□□□ -1.79
NIC96P34077 MUD1YBR119W 897 nt3.84□□□□□ -1.79
NIC96P34077 SWI1YPL016W 3945 nt3.84□□□□□ -1.79
NIC96P34077 CDC40YDR364C 1368 nt3.84□□□□□ -1.79
NIC96P34077 IOC2YLR095C 2439 nt3.84□□□□□ -1.8
NIC96P34077 ABP140YOR239W 1887 nt3.84□□□□□ -1.8
NIC96P34077 YGR237CYGR237C 2358 nt3.83□□□□□ -1.8
NIC96P34077 PHM7YOL084W 2976 nt3.83□□□□□ -1.8
NIC96P34077 PHO81YGR233C 3537 nt3.83□□□□□ -1.8
NIC96P34077 KEI1YDR367W 666 nt3.83□□□□□ -1.8
NIC96P34077 RSM18YER050C 417 nt3.83□□□□□ -1.8
NIC96P34077 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt3.83□□□□□ -1.8
NIC96P34077 VAR1Q0140 1197 nt3.83□□□□□ -1.8
NIC96P34077 LSM1YJL124C 519 nt3.83□□□□□ -1.8
NIC96P34077 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt3.83□□□□□ -1.8
NIC96P34077 SDS22YKL193C 1017 nt3.83□□□□□ -1.8
NIC96P34077 PEX11YOL147C 711 nt3.83□□□□□ -1.8
NIC96P34077 LTP1YPR073C 486 nt3.83□□□□□ -1.8
NIC96P34077 KRE2YDR483W 1329 nt3.83□□□□□ -1.8
NIC96P34077 LAS1YKR063C 1509 nt3.83□□□□□ -1.8
NIC96P34077 KRE5YOR336W 4098 nt3.83□□□□□ -1.8
NIC96P34077 ERG9YHR190W 1335 nt3.82□□□□□ -1.8
NIC96P34077 YNL011CYNL011C 1335 nt3.82□□□□□ -1.8
NIC96P34077 YCR013CYCR013C 648 nt3.82□□□□□ -1.8
NIC96P34077 RSM28YDR494W 1086 nt3.82□□□□□ -1.8
NIC96P34077 YNK1YKL067W 462 nt3.82□□□□□ -1.8
NIC96P34077 YKL069WYKL069W 543 nt3.82□□□□□ -1.8
NIC96P34077 IES3YLR052W 753 nt3.82□□□□□ -1.8
NIC96P34077 YLR364C-AYLR364C-A 123 nt3.82□□□□□ -1.8
NIC96P34077 SIW14YNL032W 846 nt3.82□□□□□ -1.8
NIC96P34077 OCA2YNL056W 594 nt3.82□□□□□ -1.8
NIC96P34077 UTP23YOR004W 765 nt3.82□□□□□ -1.8
NIC96P34077 RAD4YER162C 2265 nt3.82□□□□□ -1.8
NIC96P34077 YLR177WYLR177W 1887 nt3.81□□□□□ -1.8
NIC96P34077 POL4YCR014C 1749 nt3.81□□□□□ -1.8
NIC96P34077 RPB2YOR151C 3675 nt3.81□□□□□ -1.8
NIC96P34077 MND1YGL183C 660 nt3.81□□□□□ -1.8
NIC96P34077 YGL214WYGL214W 486 nt3.81□□□□□ -1.8
NIC96P34077 YGR073CYGR073C 372 nt3.81□□□□□ -1.8
NIC96P34077 PDX1YGR193C 1233 nt3.81□□□□□ -1.8
NIC96P34077 RNR2YJL026W 1200 nt3.81□□□□□ -1.8
NIC96P34077 PRM6YML047C 1059 nt3.81□□□□□ -1.8
NIC96P34077 TAP42YMR028W 1101 nt3.81□□□□□ -1.8
NIC96P34077 GIM3YNL153C 390 nt3.81□□□□□ -1.8
NIC96P34077 YNL184CYNL184C 327 nt3.81□□□□□ -1.8
NIC96P34077 JID1YPR061C 906 nt3.81□□□□□ -1.8
NIC96P34077 MLH2YLR035C 2088 nt3.81□□□□□ -1.8
NIC96P34077 RNR1YER070W 2667 nt3.81□□□□□ -1.8
NIC96P34077 YPS6YIR039C 1614 nt3.81□□□□□ -1.8
NIC96P34077 CTF13YMR094W 1437 nt3.8□□□□□ -1.8
NIC96P34077 SRP72YPL210C 1923 nt3.8□□□□□ -1.8
NIC96P34077 PTA1YAL043C 2358 nt3.8□□□□□ -1.8
NIC96P34077 FMN1YDR236C 657 nt3.8□□□□□ -1.8
NIC96P34077 SMX2YFL017W-A 234 nt3.8□□□□□ -1.8
NIC96P34077 MST27YGL051W 705 nt3.8□□□□□ -1.8
NIC96P34077 Q0142Q0142 177 nt3.8□□□□□ -1.8
NIC96P34077 VMA10YHR039C-A 345 nt3.8□□□□□ -1.8
NIC96P34077 YHR212CYHR212C 336 nt3.8□□□□□ -1.8
NIC96P34077 YJR112W-AYJR112W-A 330 nt3.8□□□□□ -1.8
NIC96P34077 MST28YAR033W 705 nt3.8□□□□□ -1.8
NIC96P34077 IDP2YLR174W 1239 nt3.8□□□□□ -1.8
NIC96P34077 YAR060CYAR060C 336 nt3.8□□□□□ -1.8
NIC96P34077 INP1YMR204C 1263 nt3.8□□□□□ -1.8
NIC96P34077 MIX23YBL107C 591 nt3.8□□□□□ -1.8
NIC96P34077 YOR283WYOR283W 693 nt3.8□□□□□ -1.8
NIC96P34077 YPL088WYPL088W 1029 nt3.8□□□□□ -1.8
NIC96P34077 YPR053CYPR053C 456 nt3.8□□□□□ -1.8
NIC96P34077 snR35snR35 204 nt3.8□□□□□ -1.8
NIC96P34077 ADF1YCL058W-A 342 nt3.8□□□□□ -1.8
NIC96P34077 PPZ1YML016C 2079 nt3.8□□□□□ -1.8
NIC96P34077 ANR2YKL047W 1551 nt3.8□□□□□ -1.8
NIC96P34077 GWT1YJL091C 1473 nt3.79□□□□□ -1.8
NIC96P34077 ZDS1YMR273C 2748 nt3.79□□□□□ -1.8
NIC96P34077 CIN1YOR349W 3045 nt3.79□□□□□ -1.8
NIC96P34077 YGR126WYGR126W 693 nt3.79□□□□□ -1.8
NIC96P34077 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt3.79□□□□□ -1.8
NIC96P34077 PEX18YHR160C 852 nt3.79□□□□□ -1.8
NIC96P34077 CKA1YIL035C 1119 nt3.79□□□□□ -1.8
NIC96P34077 RDN5-1RDN5-1 121 nt3.79□□□□□ -1.8
NIC96P34077 RDN5-6RDN5-6 121 nt3.79□□□□□ -1.8
NIC96P34077 SGT1YOR057W 1188 nt3.79□□□□□ -1.8
NIC96P34077 GCY1YOR120W 939 nt3.79□□□□□ -1.8
NIC96P34077 HUT1YPL244C 1020 nt3.79□□□□□ -1.8
NIC96P34077 CHS3YBR023C 3498 nt3.79□□□□□ -1.8
NIC96P34077 AVT5YBL089W 1380 nt3.78□□□□□ -1.8
NIC96P34077 SLF1YDR515W 1344 nt3.78□□□□□ -1.8
NIC96P34077 TRM11YOL124C 1302 nt3.78□□□□□ -1.8
NIC96P34077 YIL141WYIL141W 390 nt3.78□□□□□ -1.8
NIC96P34077 EFB1YAL003W 621 nt3.78□□□□□ -1.8
NIC96P34077 YLR456WYLR456W 615 nt3.78□□□□□ -1.8
NIC96P34077 YML031C-AYML031C-A 336 nt3.78□□□□□ -1.8
NIC96P34077 SUI1YNL244C 327 nt3.78□□□□□ -1.8
NIC96P34077 YOL029CYOL029C 606 nt3.78□□□□□ -1.8
NIC96P34077 SNF8YPL002C 702 nt3.78□□□□□ -1.8
NIC96P34077 YPR147CYPR147C 915 nt3.78□□□□□ -1.8
NIC96P34077 LYP1YNL268W 1836 nt3.78□□□□□ -1.8
NIC96P34077 HBT1YDL223C 3141 nt3.78□□□□□ -1.8
NIC96P34077 RED1YLR263W 2484 nt3.78□□□□□ -1.8
NIC96P34077 YDL176WYDL176W 2127 nt3.77□□□□□ -1.81
NIC96P34077 FOX2YKR009C 2703 nt3.77□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 568.7 ms