Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CXCR5P32302 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CXCR5P32302 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms