Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HOXA9P31269 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HOXA9P31269 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms