Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
COL4A5P29400 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL4A5P29400 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL4A5P29400 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL4A5P29400 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL4A5P29400 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL4A5P29400 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
COL4A5P29400 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL4A5P29400 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL4A5P29400 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL4A5P29400 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL4A5P29400 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL4A5P29400 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL4A5P29400 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL4A5P29400 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL4A5P29400 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL4A5P29400 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
COL4A5P29400 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL4A5P29400 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL4A5P29400 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL4A5P29400 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL4A5P29400 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL4A5P29400 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL4A5P29400 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL4A5P29400 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL4A5P29400 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL4A5P29400 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL4A5P29400 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL4A5P29400 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL4A5P29400 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL4A5P29400 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL4A5P29400 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL4A5P29400 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL4A5P29400 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL4A5P29400 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL4A5P29400 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL4A5P29400 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL4A5P29400 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL4A5P29400 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
COL4A5P29400 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms