Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB2P29033 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB2P29033 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB2P29033 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB2P29033 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB2P29033 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB2P29033 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB2P29033 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB2P29033 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB2P29033 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB2P29033 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB2P29033 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB2P29033 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB2P29033 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB2P29033 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB2P29033 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GJB2P29033 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJB2P29033 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJB2P29033 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJB2P29033 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJB2P29033 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJB2P29033 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GJB2P29033 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJB2P29033 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJB2P29033 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJB2P29033 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GJB2P29033 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB2P29033 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB2P29033 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB2P29033 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB2P29033 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB2P29033 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB2P29033 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB2P29033 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB2P29033 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB2P29033 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB2P29033 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB2P29033 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB2P29033 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB2P29033 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB2P29033 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GJB2P29033 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJB2P29033 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJB2P29033 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJB2P29033 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJB2P29033 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJB2P29033 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJB2P29033 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJB2P29033 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJB2P29033 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJB2P29033 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJB2P29033 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJB2P29033 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJB2P29033 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GJB2P29033 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB2P29033 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB2P29033 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB2P29033 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB2P29033 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB2P29033 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB2P29033 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB2P29033 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB2P29033 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB2P29033 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB2P29033 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB2P29033 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB2P29033 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB2P29033 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB2P29033 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB2P29033 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GJB2P29033 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJB2P29033 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJB2P29033 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJB2P29033 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJB2P29033 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJB2P29033 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJB2P29033 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJB2P29033 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GJB2P29033 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GJB2P29033 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GJB2P29033 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
GJB2P29033 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB2P29033 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB2P29033 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB2P29033 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB2P29033 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB2P29033 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB2P29033 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GJB2P29033 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB2P29033 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB2P29033 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB2P29033 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB2P29033 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB2P29033 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB2P29033 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB2P29033 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB2P29033 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GJB2P29033 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB2P29033 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GJB2P29033 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms