Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD34P28906 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD34P28906 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD34P28906 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD34P28906 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD34P28906 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD34P28906 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD34P28906 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CD34P28906 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD34P28906 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD34P28906 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD34P28906 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD34P28906 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD34P28906 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CD34P28906 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD34P28906 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD34P28906 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD34P28906 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD34P28906 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CD34P28906 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CD34P28906 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CD34P28906 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CD34P28906 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CD34P28906 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD34P28906 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD34P28906 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD34P28906 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD34P28906 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD34P28906 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD34P28906 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD34P28906 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CD34P28906 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD34P28906 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD34P28906 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD34P28906 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD34P28906 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD34P28906 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD34P28906 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD34P28906 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD34P28906 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD34P28906 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD34P28906 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD34P28906 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD34P28906 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD34P28906 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD34P28906 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD34P28906 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD34P28906 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD34P28906 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD34P28906 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD34P28906 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CD34P28906 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD34P28906 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CD34P28906 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD34P28906 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD34P28906 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD34P28906 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CD34P28906 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD34P28906 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD34P28906 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CD34P28906 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD34P28906 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD34P28906 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD34P28906 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD34P28906 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD34P28906 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD34P28906 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD34P28906 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CD34P28906 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CD34P28906 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CD34P28906 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD34P28906 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD34P28906 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD34P28906 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CD34P28906 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD34P28906 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD34P28906 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CD34P28906 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD34P28906 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD34P28906 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD34P28906 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CD34P28906 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD34P28906 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD34P28906 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD34P28906 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD34P28906 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD34P28906 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD34P28906 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD34P28906 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CD34P28906 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD34P28906 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD34P28906 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD34P28906 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD34P28906 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD34P28906 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD34P28906 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD34P28906 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD34P28906 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD34P28906 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CD34P28906 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms