Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLD1P28340 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLD1P28340 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLD1P28340 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLD1P28340 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
POLD1P28340 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLD1P28340 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
POLD1P28340 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLD1P28340 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLD1P28340 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLD1P28340 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLD1P28340 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
POLD1P28340 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
POLD1P28340 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLD1P28340 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLD1P28340 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLD1P28340 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
POLD1P28340 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
POLD1P28340 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLD1P28340 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLD1P28340 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLD1P28340 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLD1P28340 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLD1P28340 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
POLD1P28340 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLD1P28340 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLD1P28340 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLD1P28340 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLD1P28340 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLD1P28340 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLD1P28340 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLD1P28340 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLD1P28340 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
POLD1P28340 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLD1P28340 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLD1P28340 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLD1P28340 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
POLD1P28340 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
POLD1P28340 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
POLD1P28340 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLD1P28340 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLD1P28340 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLD1P28340 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
POLD1P28340 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLD1P28340 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLD1P28340 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLD1P28340 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLD1P28340 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLD1P28340 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLD1P28340 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLD1P28340 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLD1P28340 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
POLD1P28340 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
POLD1P28340 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
POLD1P28340 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
POLD1P28340 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
POLD1P28340 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLD1P28340 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLD1P28340 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
POLD1P28340 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
POLD1P28340 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLD1P28340 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
POLD1P28340 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLD1P28340 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
POLD1P28340 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
POLD1P28340 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLD1P28340 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLD1P28340 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLD1P28340 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
POLD1P28340 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLD1P28340 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
POLD1P28340 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLD1P28340 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLD1P28340 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLD1P28340 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLD1P28340 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
POLD1P28340 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLD1P28340 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLD1P28340 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLD1P28340 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLD1P28340 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
POLD1P28340 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLD1P28340 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLD1P28340 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLD1P28340 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLD1P28340 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLD1P28340 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLD1P28340 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLD1P28340 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
POLD1P28340 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLD1P28340 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLD1P28340 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLD1P28340 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLD1P28340 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLD1P28340 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLD1P28340 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLD1P28340 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLD1P28340 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
POLD1P28340 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
POLD1P28340 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms