Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HLA-DMAP28067 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-DMAP28067 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms