Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PSMB9P28065 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PSMB9P28065 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms