Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ITGA3P26006 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGA3P26006 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGA3P26006 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGA3P26006 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGA3P26006 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGA3P26006 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGA3P26006 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGA3P26006 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGA3P26006 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGA3P26006 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGA3P26006 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGA3P26006 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGA3P26006 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGA3P26006 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGA3P26006 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGA3P26006 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGA3P26006 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGA3P26006 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGA3P26006 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms