Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTSSP25774 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTSSP25774 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTSSP25774 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTSSP25774 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CTSSP25774 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTSSP25774 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTSSP25774 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTSSP25774 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTSSP25774 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTSSP25774 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTSSP25774 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTSSP25774 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CTSSP25774 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CTSSP25774 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTSSP25774 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTSSP25774 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTSSP25774 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTSSP25774 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTSSP25774 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTSSP25774 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTSSP25774 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTSSP25774 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CTSSP25774 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CTSSP25774 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTSSP25774 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTSSP25774 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTSSP25774 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTSSP25774 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTSSP25774 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTSSP25774 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTSSP25774 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTSSP25774 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CTSSP25774 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTSSP25774 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTSSP25774 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTSSP25774 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTSSP25774 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTSSP25774 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTSSP25774 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTSSP25774 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTSSP25774 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTSSP25774 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTSSP25774 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTSSP25774 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTSSP25774 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CTSSP25774 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTSSP25774 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTSSP25774 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTSSP25774 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTSSP25774 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTSSP25774 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTSSP25774 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTSSP25774 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTSSP25774 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTSSP25774 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTSSP25774 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTSSP25774 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTSSP25774 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTSSP25774 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CTSSP25774 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTSSP25774 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CTSSP25774 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTSSP25774 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTSSP25774 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CTSSP25774 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTSSP25774 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CTSSP25774 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTSSP25774 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTSSP25774 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTSSP25774 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTSSP25774 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTSSP25774 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTSSP25774 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTSSP25774 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTSSP25774 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTSSP25774 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTSSP25774 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CTSSP25774 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CTSSP25774 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTSSP25774 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTSSP25774 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTSSP25774 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTSSP25774 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTSSP25774 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTSSP25774 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTSSP25774 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTSSP25774 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTSSP25774 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTSSP25774 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTSSP25774 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CTSSP25774 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTSSP25774 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTSSP25774 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CTSSP25774 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTSSP25774 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTSSP25774 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTSSP25774 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CTSSP25774 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CTSSP25774 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms