Protein–RNA interactions for Protein: P23677

ITPKA, Inositol-trisphosphate 3-kinase A, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITPKAP23677 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITPKAP23677 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITPKAP23677 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITPKAP23677 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITPKAP23677 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ITPKAP23677 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITPKAP23677 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ITPKAP23677 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ITPKAP23677 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITPKAP23677 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITPKAP23677 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITPKAP23677 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITPKAP23677 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITPKAP23677 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITPKAP23677 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ITPKAP23677 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITPKAP23677 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ITPKAP23677 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITPKAP23677 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ITPKAP23677 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ITPKAP23677 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITPKAP23677 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITPKAP23677 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITPKAP23677 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITPKAP23677 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ITPKAP23677 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITPKAP23677 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ITPKAP23677 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ITPKAP23677 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITPKAP23677 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ITPKAP23677 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITPKAP23677 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ITPKAP23677 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITPKAP23677 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITPKAP23677 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ITPKAP23677 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITPKAP23677 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ITPKAP23677 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITPKAP23677 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITPKAP23677 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ITPKAP23677 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITPKAP23677 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITPKAP23677 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITPKAP23677 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITPKAP23677 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITPKAP23677 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ITPKAP23677 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITPKAP23677 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITPKAP23677 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ITPKAP23677 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITPKAP23677 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITPKAP23677 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITPKAP23677 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITPKAP23677 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITPKAP23677 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITPKAP23677 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ITPKAP23677 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITPKAP23677 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ITPKAP23677 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITPKAP23677 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITPKAP23677 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITPKAP23677 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITPKAP23677 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITPKAP23677 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ITPKAP23677 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ITPKAP23677 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITPKAP23677 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITPKAP23677 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITPKAP23677 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITPKAP23677 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ITPKAP23677 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITPKAP23677 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITPKAP23677 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITPKAP23677 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITPKAP23677 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITPKAP23677 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ITPKAP23677 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITPKAP23677 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITPKAP23677 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITPKAP23677 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITPKAP23677 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITPKAP23677 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ITPKAP23677 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITPKAP23677 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITPKAP23677 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ITPKAP23677 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ITPKAP23677 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ITPKAP23677 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITPKAP23677 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ITPKAP23677 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ITPKAP23677 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITPKAP23677 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITPKAP23677 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ITPKAP23677 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ITPKAP23677 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITPKAP23677 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITPKAP23677 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ITPKAP23677 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITPKAP23677 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITPKAP23677 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms