Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHCGRP22888 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LHCGRP22888 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHCGRP22888 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHCGRP22888 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHCGRP22888 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHCGRP22888 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHCGRP22888 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LHCGRP22888 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LHCGRP22888 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LHCGRP22888 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LHCGRP22888 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LHCGRP22888 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LHCGRP22888 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LHCGRP22888 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LHCGRP22888 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LHCGRP22888 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms