Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ABCB4P21439 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ABCB4P21439 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms