Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NF1P21359 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NF1P21359 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NF1P21359 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NF1P21359 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NF1P21359 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NF1P21359 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NF1P21359 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NF1P21359 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NF1P21359 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NF1P21359 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NF1P21359 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NF1P21359 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NF1P21359 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NF1P21359 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NF1P21359 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NF1P21359 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NF1P21359 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NF1P21359 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NF1P21359 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NF1P21359 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NF1P21359 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NF1P21359 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NF1P21359 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NF1P21359 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NF1P21359 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NF1P21359 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NF1P21359 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NF1P21359 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NF1P21359 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NF1P21359 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NF1P21359 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NF1P21359 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NF1P21359 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NF1P21359 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NF1P21359 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NF1P21359 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NF1P21359 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NF1P21359 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NF1P21359 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NF1P21359 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NF1P21359 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NF1P21359 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NF1P21359 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NF1P21359 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NF1P21359 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NF1P21359 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NF1P21359 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NF1P21359 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NF1P21359 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NF1P21359 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NF1P21359 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NF1P21359 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NF1P21359 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NF1P21359 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NF1P21359 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NF1P21359 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NF1P21359 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NF1P21359 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NF1P21359 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NF1P21359 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NF1P21359 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NF1P21359 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NF1P21359 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NF1P21359 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NF1P21359 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NF1P21359 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NF1P21359 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NF1P21359 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NF1P21359 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NF1P21359 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NF1P21359 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NF1P21359 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NF1P21359 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NF1P21359 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NF1P21359 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NF1P21359 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NF1P21359 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NF1P21359 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NF1P21359 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NF1P21359 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NF1P21359 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NF1P21359 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NF1P21359 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NF1P21359 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NF1P21359 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NF1P21359 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NF1P21359 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NF1P21359 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NF1P21359 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NF1P21359 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NF1P21359 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NF1P21359 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NF1P21359 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NF1P21359 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NF1P21359 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NF1P21359 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NF1P21359 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NF1P21359 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NF1P21359 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms