Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LMNB1P20700 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LMNB1P20700 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms