Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB1P20618 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB1P20618 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB1P20618 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB1P20618 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB1P20618 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB1P20618 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms