Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFE3P19532 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFE3P19532 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFE3P19532 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFE3P19532 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFE3P19532 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFE3P19532 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFE3P19532 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFE3P19532 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFE3P19532 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFE3P19532 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFE3P19532 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFE3P19532 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFE3P19532 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFE3P19532 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFE3P19532 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFE3P19532 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFE3P19532 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFE3P19532 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TFE3P19532 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFE3P19532 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFE3P19532 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFE3P19532 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFE3P19532 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFE3P19532 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFE3P19532 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFE3P19532 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TFE3P19532 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFE3P19532 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFE3P19532 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TFE3P19532 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFE3P19532 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFE3P19532 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFE3P19532 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFE3P19532 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFE3P19532 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFE3P19532 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFE3P19532 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFE3P19532 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFE3P19532 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TFE3P19532 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFE3P19532 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFE3P19532 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TFE3P19532 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TFE3P19532 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFE3P19532 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TFE3P19532 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFE3P19532 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFE3P19532 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TFE3P19532 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFE3P19532 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFE3P19532 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFE3P19532 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFE3P19532 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFE3P19532 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TFE3P19532 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TFE3P19532 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFE3P19532 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFE3P19532 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFE3P19532 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFE3P19532 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFE3P19532 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFE3P19532 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFE3P19532 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFE3P19532 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFE3P19532 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFE3P19532 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TFE3P19532 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFE3P19532 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFE3P19532 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFE3P19532 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFE3P19532 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFE3P19532 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TFE3P19532 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TFE3P19532 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TFE3P19532 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TFE3P19532 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TFE3P19532 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFE3P19532 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFE3P19532 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFE3P19532 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFE3P19532 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFE3P19532 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFE3P19532 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFE3P19532 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFE3P19532 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFE3P19532 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TFE3P19532 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFE3P19532 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFE3P19532 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFE3P19532 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFE3P19532 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFE3P19532 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFE3P19532 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFE3P19532 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFE3P19532 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TFE3P19532 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFE3P19532 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFE3P19532 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TFE3P19532 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms