Protein–RNA interactions for Protein: P19320

VCAM1, Vascular cell adhesion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCAM1P19320 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VCAM1P19320 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
VCAM1P19320 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms