Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD58P19256 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD58P19256 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD58P19256 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD58P19256 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CD58P19256 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD58P19256 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD58P19256 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD58P19256 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD58P19256 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD58P19256 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CD58P19256 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CD58P19256 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD58P19256 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD58P19256 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD58P19256 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD58P19256 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD58P19256 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD58P19256 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD58P19256 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD58P19256 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD58P19256 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD58P19256 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD58P19256 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD58P19256 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD58P19256 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD58P19256 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD58P19256 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CD58P19256 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD58P19256 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD58P19256 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CD58P19256 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD58P19256 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD58P19256 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD58P19256 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD58P19256 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD58P19256 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD58P19256 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD58P19256 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD58P19256 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD58P19256 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD58P19256 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD58P19256 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD58P19256 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD58P19256 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD58P19256 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD58P19256 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD58P19256 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD58P19256 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD58P19256 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD58P19256 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD58P19256 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD58P19256 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD58P19256 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD58P19256 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD58P19256 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD58P19256 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD58P19256 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD58P19256 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD58P19256 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD58P19256 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD58P19256 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CD58P19256 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD58P19256 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD58P19256 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CD58P19256 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD58P19256 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD58P19256 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD58P19256 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD58P19256 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD58P19256 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD58P19256 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD58P19256 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD58P19256 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD58P19256 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD58P19256 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD58P19256 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD58P19256 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD58P19256 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD58P19256 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD58P19256 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CD58P19256 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CD58P19256 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CD58P19256 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD58P19256 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD58P19256 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD58P19256 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD58P19256 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CD58P19256 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD58P19256 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD58P19256 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD58P19256 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD58P19256 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD58P19256 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD58P19256 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD58P19256 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD58P19256 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD58P19256 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD58P19256 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CD58P19256 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms