Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EGR1P18146 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EGR1P18146 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EGR1P18146 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EGR1P18146 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EGR1P18146 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EGR1P18146 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
EGR1P18146 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EGR1P18146 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EGR1P18146 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EGR1P18146 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EGR1P18146 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EGR1P18146 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EGR1P18146 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EGR1P18146 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EGR1P18146 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EGR1P18146 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EGR1P18146 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EGR1P18146 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EGR1P18146 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EGR1P18146 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EGR1P18146 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EGR1P18146 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EGR1P18146 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EGR1P18146 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EGR1P18146 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EGR1P18146 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EGR1P18146 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EGR1P18146 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EGR1P18146 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EGR1P18146 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
EGR1P18146 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EGR1P18146 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EGR1P18146 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EGR1P18146 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EGR1P18146 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
EGR1P18146 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EGR1P18146 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EGR1P18146 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EGR1P18146 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EGR1P18146 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EGR1P18146 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EGR1P18146 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
EGR1P18146 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
EGR1P18146 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
EGR1P18146 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
EGR1P18146 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EGR1P18146 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EGR1P18146 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EGR1P18146 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EGR1P18146 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EGR1P18146 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EGR1P18146 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EGR1P18146 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EGR1P18146 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EGR1P18146 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EGR1P18146 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EGR1P18146 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
EGR1P18146 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EGR1P18146 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EGR1P18146 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EGR1P18146 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EGR1P18146 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EGR1P18146 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EGR1P18146 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EGR1P18146 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EGR1P18146 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EGR1P18146 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR1P18146 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR1P18146 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR1P18146 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR1P18146 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR1P18146 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR1P18146 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR1P18146 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR1P18146 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR1P18146 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR1P18146 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR1P18146 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR1P18146 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR1P18146 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR1P18146 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR1P18146 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR1P18146 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR1P18146 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR1P18146 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR1P18146 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR1P18146 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR1P18146 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR1P18146 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR1P18146 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR1P18146 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR1P18146 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR1P18146 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EGR1P18146 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EGR1P18146 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EGR1P18146 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EGR1P18146 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EGR1P18146 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EGR1P18146 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms