Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GM2AP17900 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GM2AP17900 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GM2AP17900 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GM2AP17900 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GM2AP17900 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GM2AP17900 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GM2AP17900 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GM2AP17900 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GM2AP17900 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GM2AP17900 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GM2AP17900 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GM2AP17900 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GM2AP17900 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GM2AP17900 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GM2AP17900 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GM2AP17900 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GM2AP17900 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GM2AP17900 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GM2AP17900 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GM2AP17900 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GM2AP17900 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GM2AP17900 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GM2AP17900 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GM2AP17900 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GM2AP17900 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GM2AP17900 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GM2AP17900 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GM2AP17900 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GM2AP17900 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GM2AP17900 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GM2AP17900 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GM2AP17900 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GM2AP17900 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GM2AP17900 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GM2AP17900 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GM2AP17900 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GM2AP17900 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GM2AP17900 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GM2AP17900 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GM2AP17900 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GM2AP17900 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GM2AP17900 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GM2AP17900 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GM2AP17900 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GM2AP17900 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GM2AP17900 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GM2AP17900 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GM2AP17900 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GM2AP17900 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GM2AP17900 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GM2AP17900 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GM2AP17900 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GM2AP17900 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GM2AP17900 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GM2AP17900 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GM2AP17900 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GM2AP17900 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GM2AP17900 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GM2AP17900 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GM2AP17900 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GM2AP17900 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GM2AP17900 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GM2AP17900 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GM2AP17900 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GM2AP17900 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GM2AP17900 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GM2AP17900 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GM2AP17900 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GM2AP17900 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GM2AP17900 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GM2AP17900 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GM2AP17900 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GM2AP17900 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GM2AP17900 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GM2AP17900 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GM2AP17900 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GM2AP17900 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GM2AP17900 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GM2AP17900 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GM2AP17900 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GM2AP17900 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GM2AP17900 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GM2AP17900 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GM2AP17900 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GM2AP17900 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GM2AP17900 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GM2AP17900 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GM2AP17900 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GM2AP17900 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GM2AP17900 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GM2AP17900 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GM2AP17900 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GM2AP17900 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GM2AP17900 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GM2AP17900 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GM2AP17900 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GM2AP17900 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GM2AP17900 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GM2AP17900 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms