Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HLA-EP13747 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HLA-EP13747 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms