Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFHP12036 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFHP12036 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFHP12036 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFHP12036 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFHP12036 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFHP12036 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFHP12036 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFHP12036 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFHP12036 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFHP12036 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFHP12036 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFHP12036 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFHP12036 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEFHP12036 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFHP12036 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFHP12036 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFHP12036 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFHP12036 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFHP12036 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFHP12036 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFHP12036 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFHP12036 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFHP12036 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFHP12036 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFHP12036 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFHP12036 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFHP12036 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEFHP12036 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEFHP12036 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NEFHP12036 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NEFHP12036 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NEFHP12036 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEFHP12036 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEFHP12036 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEFHP12036 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEFHP12036 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEFHP12036 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NEFHP12036 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEFHP12036 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NEFHP12036 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NEFHP12036 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NEFHP12036 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NEFHP12036 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEFHP12036 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEFHP12036 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEFHP12036 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEFHP12036 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEFHP12036 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEFHP12036 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
NEFHP12036 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEFHP12036 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEFHP12036 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NEFHP12036 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NEFHP12036 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEFHP12036 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEFHP12036 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEFHP12036 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEFHP12036 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NEFHP12036 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEFHP12036 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NEFHP12036 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NEFHP12036 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NEFHP12036 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NEFHP12036 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEFHP12036 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEFHP12036 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NEFHP12036 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEFHP12036 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NEFHP12036 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEFHP12036 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NEFHP12036 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEFHP12036 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEFHP12036 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEFHP12036 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NEFHP12036 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NEFHP12036 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NEFHP12036 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEFHP12036 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NEFHP12036 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEFHP12036 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEFHP12036 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEFHP12036 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEFHP12036 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEFHP12036 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEFHP12036 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NEFHP12036 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NEFHP12036 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEFHP12036 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEFHP12036 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NEFHP12036 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NEFHP12036 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEFHP12036 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEFHP12036 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NEFHP12036 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEFHP12036 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NEFHP12036 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NEFHP12036 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEFHP12036 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NEFHP12036 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms